门面房所有权和收益分配问题

买了一套门面房200万，首付我们出了100万，子女和她配偶出了20万，房产证上写的是我和女儿的名字，但是份额写的是我1%，女儿99%，贷款部分四人一起偿还，现在为了让自己的权益有个保障，可以写份协议书，就是把首付款和还贷情况写清楚，然后大家签字吗？这样以后有纠纷，比如房租收益分配上有纠纷，是按真实的出资比例分配房租还是按房产证上的份额，或者以后卖了所得房款是按实际出资还是房产证上的份额分配，谢谢您的解答！