征地

您可以看一下和政府所签订的协议，支付的补偿款是征地的补偿款，还是取土的补偿款。以上意见，仅供参考。

没有协议书

如果没有签订协议的话，从法律角度看，很难判断出归属。建议您和村委会协商此事，明确双方的权利和义务。以上意见，仅供参考。

现在确权登记面积还在我们名下

因为不清楚您承包的手续、土地的性质以及农村土地存在很多违法承包、转包、建设等问题，建议您带齐您的材料至当地的土地管理局咨询。