工资发放

想咨询一个事情。是这样的，一名主管是南京分公司负责人，总公司在深圳，因公司业务调整，从今年456月份开始工资发一半，789月份甚至不发工资，五险一金交的（相当于遣散，自负盈亏）目前是租的房子人家房东想退租，11 12月份钱想退还，因无法开具发票，目前要退半年房租大概七万多，请问主管可以将其发放员工和个人工资吗？违法吗？（45678910几个月依然在为公司处理业务，只是不坐班）