劳动合同到期

按照你的描述，签的是南京的合同，但又在安徽公司工作，又是一家公司下的两个公司。您应当了解一下这两个地方的公司是子公司还是分公司，合同盖章的单位是谁？如果感觉对自身影响不大，可以跟安徽续签合同，或者拒绝，合同尊重双方当事人意愿。

如果拒签的话会有适当的赔偿吗

要看拒绝的理由具体是什么？并非一概而论。