劳动纠纷

我一同事，是专业客运司机，在一次夜间驾驶工作途中，由于开车行李箱门突然自动弹开，导致乘客行李箱丢失，经于失主多次协商赔偿了对方3000元，现在公司扣了司机2000元作为赔偿，这样的处理合理合法吗？谢谢！