房产证和土地使用证重叠

您好，我家住农村，17年前政府批了我家一块房产证，那时候政府已经不在办法土地使用证了。我家在房产证规定的土地上建了房，原来那块地是小土山，是我家找挖掘机挖了很久弄平建的房子。现在17年后邻居法院告我们家侵占他家土地，要求我家拆房赔钱。目前就是我家房产证和他家老的土地使用证重叠了，怎么办？