离职

应届毕业生，07月入职，试用期3个月，签的合同是3年，入职前签订了就业协议，说有违约金3000，但是可以不用交，说违约了再交，然后入职以后签订的劳动合同，现在准备离职，说要3000违约金加入职后的体检培训费用一共加起来四千多，由于我个人原因五险一金还没交，报到证也不在医院，这个违约金我要交吗？